„Pumuckl und das große Missverständnis“ ist eine Neuverfilmung der Abenteuer des rothaarigen Kobolds Pumuckl und Meister Eders Neffen Florian. In diesem Film geht es um den Sommer, in dem Pumuckl und Florian viele Abenteuer erleben. Sie machen einen Ausflug aufs Land, feiern den Geburtstag des Nachbarn Burke und treffen auf eine neugierige Schildkröte.
Doch die vielen Ereignisse bringen ihre Freundschaft an ihre Grenzen. Ein großes Missverständnis droht, Pumuckl und Florian auseinanderzubrechen.